Smith-Waterman Algorithm — Step-by-step Explanations
Smith-Waterman algorithm is a dynamic programming approach used to solve pairwise local sequence alignment. It involves computing a two-dimensional (2D) matrix using the match, mismatch, and gap penalty scores. Solving the matrix consist of three stages: (1) initialization, (2) matrix filling, and (3) traceback. Temple Ferris Smith and Michael Spencer Waterman introduced this algorithm during the year 1981.
This video tutorial contains step-by-step explanations to solve Smith-Waterman algorithm. For the matrix filling stage, I have chosen BABA (Basic Algorithms of Bioinformatics Applet) Java applet program for formula calculations and traceback. The BABA tool can be freely downloaded from SourceForge (https://sourceforge.net/projects/baba/).
Alterative Source: https://biogem.org/downloads/software/baba.jar
Command-line: java -jar baba.jar
---------------------------------------------------------------------------------------
My Blog: https://www.biob.in
Website: http://www.biogem.org
My Vlog: https://www.youtube.com/AshokKumarBioIT
YouTube Handle: https://youtube.com/@AKBIT
My GitHub: https://github.com/AshokHub
---------------------------------------------------------------------------------------
Background Music:
► Music By Scandinavianz - Coco Islands : https://soundcloud.com/scandinavianz/...
► Music provided by NCS BEST OF : https://youtu.be/A8AVt8MoUpk
#BioGem #biogem.org #BioBIN #biob.in #Bioinformatics #AKBIT #Sequence_Alignment #Smith-Waterman #BABA #SourceForge
Что делает видео по-настоящему запоминающимся? Наверное, та самая атмосфера, которая заставляет забыть о времени. Когда вы заходите на RUVIDEO, чтобы посмотреть онлайн «Smith-Waterman Algorithm — Step-by-step Explanations», вы рассчитываете на нечто большее, чем просто загрузку плеера. И мы это понимаем. Контент такого уровня заслуживает того, чтобы его смотрели в HD 1080, без дрожания картинки и бесконечного буферизации.
Честно говоря, Rutube сегодня — это кладезь уникальных находок, которые часто теряются в общем шуме. Мы же вытаскиваем на поверхность самое интересное. Будь то динамичный экшн, глубокий разбор темы от любимого автора или просто уютное видео для настроения — всё это доступно здесь бесплатно и без лишних формальностей. Никаких «заполните анкету, чтобы продолжить». Только вы, ваш экран и качественный поток.
Если вас зацепило это видео, не забудьте взглянуть на похожие материалы в блоке справа. Мы откалибровали наши алгоритмы так, чтобы они подбирали контент не просто «по тегам», а по настроению и смыслу. Ведь в конечном итоге, онлайн-кинотеатр — это не склад файлов, а место, где каждый вечер можно найти свою историю. Приятного вам отдыха на RUVIDEO!
Видео взято из открытых источников Rutube. Если вы правообладатель, обратитесь к первоисточнику.