Example scRNAseq analysis in PyMINEr with python or command line (with docker option!)
This is a walk-through of how to use PyMINEr for analyzing scRNAseq data either interactively in the console with python or at the command line. Plus you can use Docker!
You can download the example input:
https://drive.google.com/file/d/1XOmHT8M_0L3Y-jPkb-6jS8TxLobC1-HG/view?usp=sharing
and the example genes of interest:
https://drive.google.com/open?id=18jvP99Fw2QAGXuT4pgJdJuwJBfAahqXc
Note that a typical PyMINEr input expression matrix should be the final, filtered, log transformed tsv file, or hdf5 file as described here: https://www.youtube.com/watch?v=2gmQuQEMUXM
Что делает видео по-настоящему запоминающимся? Наверное, та самая атмосфера, которая заставляет забыть о времени. Когда вы заходите на RUVIDEO, чтобы посмотреть онлайн «Example scRNAseq analysis in PyMINEr with python or command line (with docker option!)», вы рассчитываете на нечто большее, чем просто загрузку плеера. И мы это понимаем. Контент такого уровня заслуживает того, чтобы его смотрели в HD 1080, без дрожания картинки и бесконечного буферизации.
Честно говоря, Rutube сегодня — это кладезь уникальных находок, которые часто теряются в общем шуме. Мы же вытаскиваем на поверхность самое интересное. Будь то динамичный экшн, глубокий разбор темы от любимого автора или просто уютное видео для настроения — всё это доступно здесь бесплатно и без лишних формальностей. Никаких «заполните анкету, чтобы продолжить». Только вы, ваш экран и качественный поток.
Если вас зацепило это видео, не забудьте взглянуть на похожие материалы в блоке справа. Мы откалибровали наши алгоритмы так, чтобы они подбирали контент не просто «по тегам», а по настроению и смыслу. Ведь в конечном итоге, онлайн-кинотеатр — это не склад файлов, а место, где каждый вечер можно найти свою историю. Приятного вам отдыха на RUVIDEO!
Видео взято из открытых источников Rutube. Если вы правообладатель, обратитесь к первоисточнику.