Statistical workflows with Galaxy
Statistical analysis provides powerful approaches to mine complex and high-dimension datasets, find significant features, and build prediction models with high-prediction performance. Due to the high number of methods available, their complex mathematical background, and the potential pitfalls due to biases and overfitting, a good understanding of each step as well as an environment allowing to efficiently manage the whole workflow, are of major importance.
In this webinar, we will see how to build a statistical workflow within the user-friendly Galaxy environment, including: normalization (signal drift and batch effect), quality control, univariate hypothesis testing, multivariate modelling with (Orthogonal) Partial Least Squares, and feature selection (with Partial Least Squares, Random Forest and Support Vector Machines).
Our example dataset (MTBLS404), the Sacurine study, aims at discovering physiological variations of the human urine metabolome with age, body mass index, and gender. We will be using the PhenoMeNal platform. We will also see how data from the MetaboLights repository can be uploaded directly into Galaxy workflows. Additional statistical modules and public analyses are available on the Workflow4Metabolomics platform.
This webinar was recorded on 8 June 2018 and was presented by Etienne Thévenot. The slides from this webinar can be downloaded in Train online.
https://www.ebi.ac.uk/training/online/course/metabolomics-data-analysis-cloud-online-training-series/statistical-workflows-galaxy
This webinar is part of the Metabolomics data analysis in the Cloud: online training series. Find the whole series in Train online.
https://www.ebi.ac.uk/training/online/course/metabolomics-data-analysis-cloud-online-training-series
For more EMBL-EBI webinars see your webinars listings:
https://www.ebi.ac.uk/training/webinars
Что делает видео по-настоящему запоминающимся? Наверное, та самая атмосфера, которая заставляет забыть о времени. Когда вы заходите на RUVIDEO, чтобы посмотреть онлайн «Statistical workflows with Galaxy», вы рассчитываете на нечто большее, чем просто загрузку плеера. И мы это понимаем. Контент такого уровня заслуживает того, чтобы его смотрели в HD 1080, без дрожания картинки и бесконечного буферизации.
Честно говоря, Rutube сегодня — это кладезь уникальных находок, которые часто теряются в общем шуме. Мы же вытаскиваем на поверхность самое интересное. Будь то динамичный экшн, глубокий разбор темы от любимого автора или просто уютное видео для настроения — всё это доступно здесь бесплатно и без лишних формальностей. Никаких «заполните анкету, чтобы продолжить». Только вы, ваш экран и качественный поток.
Если вас зацепило это видео, не забудьте взглянуть на похожие материалы в блоке справа. Мы откалибровали наши алгоритмы так, чтобы они подбирали контент не просто «по тегам», а по настроению и смыслу. Ведь в конечном итоге, онлайн-кинотеатр — это не склад файлов, а место, где каждый вечер можно найти свою историю. Приятного вам отдыха на RUVIDEO!
Видео взято из открытых источников Rutube. Если вы правообладатель, обратитесь к первоисточнику.