Tutorial for Performing In Silico Protein Mutagenesis using Python Wrapper Mutatex employing Foldx
In this tutorial I will show you how to perform computational protein mutagenesis (mutate protein computationally) between an antibody and protein using mutatex, which can be found here: https://github.com/ELELAB/mutatex.
MutateX employs the FoldX (foldx) version 5.0 energy that has been tested on a data set of more than 1000 sequence variants from over 20 different proteins with a typical prediction error of 0.8 kcal/mol. FoldX can be downloaded here with academic or commercial license: http://foldxsuite.crg.eu/academic-license-info
In the future I will show how to analyze the results obtained from the software.
If you found this tutorial useful, please like and subscribe.
To install MutateX check out this link:
https://github.com/ELELAB/mutatex/blob/master/INSTALL
All commands used in this video:
mutatex new.pdb -m mutation_list.txt -f suite5 -R repair_runfile_template.txt
-M mutate_runfile_template.txt -I interface_runfile_template.txt -B
Что делает видео по-настоящему запоминающимся? Наверное, та самая атмосфера, которая заставляет забыть о времени. Когда вы заходите на RUVIDEO, чтобы посмотреть онлайн «Tutorial for Performing In Silico Protein Mutagenesis using Python Wrapper Mutatex employing Foldx», вы рассчитываете на нечто большее, чем просто загрузку плеера. И мы это понимаем. Контент такого уровня заслуживает того, чтобы его смотрели в HD 1080, без дрожания картинки и бесконечного буферизации.
Честно говоря, Rutube сегодня — это кладезь уникальных находок, которые часто теряются в общем шуме. Мы же вытаскиваем на поверхность самое интересное. Будь то динамичный экшн, глубокий разбор темы от любимого автора или просто уютное видео для настроения — всё это доступно здесь бесплатно и без лишних формальностей. Никаких «заполните анкету, чтобы продолжить». Только вы, ваш экран и качественный поток.
Если вас зацепило это видео, не забудьте взглянуть на похожие материалы в блоке справа. Мы откалибровали наши алгоритмы так, чтобы они подбирали контент не просто «по тегам», а по настроению и смыслу. Ведь в конечном итоге, онлайн-кинотеатр — это не склад файлов, а место, где каждый вечер можно найти свою историю. Приятного вам отдыха на RUVIDEO!
Видео взято из открытых источников Rutube. Если вы правообладатель, обратитесь к первоисточнику.